宏基因組是利用高通量測(cè)序技術(shù)以特定環(huán)境下微生物群體基因組為研究對(duì)象,在分析微生物多樣性、種群結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步探究微生物群體功能活性、相互協(xié)作關(guān)系及與環(huán)境之間的關(guān)系,發(fā)掘潛在的生物學(xué)意義。
| 產(chǎn)品類型 | 文庫(kù)類型 | 核酸樣本送樣要求 |
| 二代宏基因組測(cè)序 | 350 bp小片段文庫(kù) | 樣本類型:無(wú)蛋白和RNA污染的樣品 |
| 樣品需求量:≥200 ng | ||
| 樣品濃度:≥5 ng/μL | ||
| 樣品純度:OD260/280=1.6~2.2 OD260/230=0.8~2.2 |
| 環(huán)境樣品 | 種類 | 送樣量 | 備注 |
| 土壤類 | 普通土壤 | 5-10 g/管 | 建議每個(gè)樣本取3~5管以上備份 |
| 根際土壤 | |||
| 淤泥/污泥 | |||
| 糞便類 | 大型動(dòng)物糞便 | 100-200 mg/管 | |
| 小型動(dòng)物顆粒糞便 | 小鼠 ≥ 5 粒,大鼠 ≥ 3 粒 | ||
| 腸道內(nèi)容物 | 500mg/管 建議每個(gè)樣本取4-5管以上 | ||
| 濾膜類 | 水體濾膜 | 過(guò)濾5-10 L | |
| 拭子類 | 拭子類 | 2-3個(gè)拭子棉簽頭/管 | |
| 唾液類 | 唾液類 | 2-5 mL |